Ну не умеет 98 делать автоматом меню загрузки. То что ты сделал (запустил что-нибудь из XP после установки 98) -- правильное решение (лучший вариант только сначала ставить 98, а потом XP).

А вот почему теперь 98 не грузится -- мне непонятно.
XP на C:, 98 на D:? Оба диска FAT(32)?

Я посмотрел на аналогичной машине и понял, что мне у тебя не нравится.
Ты пишешь
error multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS
Это выражение из файла C:\boot.ini
Вот как выглядит этот файл у меня (98 на C:, XP на D:):

Т.е. partition нумеруются не с нуля, а с единицы, а для 98 указывается просто буква диска.
Видимо, у тебя этот файл должен быть таким:

Загрузись в ХР и отредактируй руками. Осторожно...
Если нахомутаешь, повтори FIXBOOT.

Я, может быть, ошибся. Скорее всего, Win98 даже если и установлено на D:, грузиться всё равно умеет только с C:
Т.е. в boot.ini надо попробовать написать всё-таки
C:\="Microsoft Windows 98"
(и default=C:\)

О результатах сообщи обязательно (если сможешь загрузиться :) ).
Не забывай, что можно загрузиться с дискеты и с компакта.

Наконец-то я слышу голос не мальчика, но мужа, который знает теорию.

Т.е. надо сделать так:
1) загрузиться с системной дискеты или компакта Windows 98;
2) сделать sys c: (это пропишет досовский бутсектор);
3) загрузиться с компакта ХР и запустить ИНСТАЛЛЯЦИЮ Win XP, выбрать для неё другую папку (например, WINDOWS1) (можно и на другом диске);
4) когда она первый раз предложит перезагрузиться, перехватить загрузку по F8 (начать нажимать с самого начала) и через "возврат к выбору операционной системы" выбрать не XP, а 98;
5) из boot.ini удалить строчку про новую XP (отличить по папке), а также выставить подходящий timeout;
6) удалить временную папку WINDOWS1.

И радоваться жизни.
Я эту инструкцию сам выполнил (предварительно удалив bootsect.dos).