для дефрагментации больших файлов необходимо чтоб на диске было место куда б этот файл поместить без разбиения на части. если такого промежутка нет - файл не дефрагментируется.
этим страдают почти фсе дефрагментаторы.
для освобождения место (уплотнения расположения файлов) пользоваться системной утилитой окон ХР. но и она требует достаточного свободного места на диске (не менее15%, если не ошибаюсь)
дефрагментатор от симантека не панацея. хотя и даёт больше возможностей. но он платный.
для дефрагментации системных файлов подойдет pagedfrg от Марка Русинович
для всего диска AusLogics Disk Defrag всё свободное. + системная прога дефрагментации

это и значит дефрагментировать.
полная дефрагментация означает ещё и пермещение файлов к началу диска (системная утилита это делает) и кроме того сортировка расположения по частоте обращения (это делает симантек)
простая дефрагментация - просто соединение файла в один кусок на диске.
это всё не надолго.
самое оптимальное произвести дефрагментацию пэйдж файла.
но чтоб он оставался не фрагментированным необходимо задать его минимальный и максимальный размер равными.

если происходит частая установка/удаление программ желательно установить pagedfrg