Зависит от того, что нужно: как я понимаю, регнастройки процессами не наследуются - если для данного процесса cmd изменить эти настройки, процессы, созданные им будут иметь настройки для текущего пользователя, а не родительского процесса cmd.

Если нужно изменить настройки самого cmd, можно извратиться, написав маленькую программу, которая:
1. Получает Id родительского процесса
2. Внедряет в родительский процесс dll, которая вызывает SetThreadLocale для потоков этого процесса

Работоспособность этой схемы я не проверял, возможно, есть более прямой путь.