1) если брать минимальный сервер с возможностью его модернизации смотри
на корпус в который можно вставить от 8 ми жестких дисков
Например такой. http://www.supermicro.com/products/chassis/4U/743/SC743TQ-865-SQ.cfm
Тихо работает (на случай если серверной нету и он будет стоять рядом с людьми) . Можно ставить и в стойку и на стол(как обычный комп).
Недостаток - 1 блок питания. Но ничего более тихого не найдешь.
Или такой в стойку с двумя БП
http://www.supermicro.com/products/chassis/2U/829/SC829TQ-R920LP.cfm

ПО соотношению цена\надежностость супермикро будет лучше(дешевле) брендовых серверов типа IBM , HP proliant


Я бы сразу использовал виртуализацию , есть бесплатные варианты Vmware ESXi (например)

Далее на сервер ставишь отдельной ОС - контроллер домена, отдельной ОС - 1c. Они работают одновременно. В случае выхода из строя сервера можно запустить все на другом в течении 5 минут. И не ждать пока приедут запчасти ( А это зачастую будет простой всей конторы 1-2 дня)

Ну и админить, бекапить и т.д. Будет гораздо проще, быстрее.


Цитата "Что вообще нужно для построения доменной (+ "защищенной") сети? "

Хотя бы не расшаривать общую папку с базами 1с в локальную сеть.
1) Любой кто пользуется 1с может случайно(специально) удалить базы
2) Скопировать базу из расшареной папки себе на флешку и унести домой
3) Базу могут поломать вирусы...
Т.е. безопастности и надежности тут 0

Исходя из этого для базовой надежности и безопасности (и хотя бы что бы спокойно уйти в отпуск) нужно

1) Организовать резервное копирование всей важной инфы!
Т.е. копировать инфу на ОТДЕЛЬНОЕ устройство (если вдруг сервер сломался ) , что бы можно было вытащить инфу.
Самый дешевый вариант - HP microserver - по размерам как пол-компа обычного. влазит 4 винчестера. Стоит 13 000р. + 7 000 р два винчестера на 2000 ГБ. Туда ставишь ОС (желательно не виндовс, что бы вирусы не поели) и копируешь ежедневно базы и возможно информацию с компьютеров сотрудников.(почта)
http://www.proliant.ru/catalog/servery_hp_proliant_microserver/hp_proliant_n36l_612275-421.html

Есть готовые коробки с винтами , например qnap http://qnap.ru/content/catalogue/smb/250 но подороже. Или из старого компа сделать. Важно что бы он стоял отдельно и ни кто на нем не работал.

2) Сделай терминальный сервер 1с. С таким количеством народа ничего тупить не будет. (исхожу из того, что сейчас нету сервера и ничего не тупит)
Люди будут работать не с файлами а с картинкой. Унести не смогут, поломать тоже.
Если комп сотрудника вылетел он за 1 минуту подключается с любого другого компа (или даже из дома)
В терминалке масса плюсов.

Минимальная конфигурация сервера .
4 ядра - 2 SAS винчестера , 8 гб ОЗУ.
лучше 1 проц ,6 ядер , 4-8 sas винтов, RAID 10.
Озвучиваешь поставщику конфигурацию и тебе говорят цену. Самому лучше не собирать.
Если денег мало бери собраный сервер на платформе INTEL или SUPERMICRO
если хватает то IBM, HP, DELL

И еще раз советую внедрить сразу виртуализацию.