это из Support Tools (на диске 2003-го, папка Support), утилиты диагностики
Насчет ошибки: контроллеры в одном сайте?
Как вообще удаляют контроллеры:
1) надо убедиться, что все реплицировано на новый (все - это Configuration Partition, Schema Partition, Domain Partition, Application Partition(s) - последнее это как минимум ДНС леса и домена). Проверить, что и как реплицируется (а также пнуть, чтобы сделали это живее), можно через Пуск-Выполнить-replmon
2) В Active Directory Sites and Services перейдите до элемента NTDS нового сервера и поставьте на нем галку Global Catalog
3) передайте новому серверу все FSMO-роли:
Configuration (Domain Naming) Master
Schema Master
(эти 2 роли передаются так: Active Directory Domains and Trusts, затем правой по ноде Active Directory Domains and Trusts - Operations Masters - Change)
PDC
RID Master
Infrastructure Master
(последние три передаются так: правой по домену в Active Directory Users and Computers - Operations Masters - Change)
У кого какие роли в заданный момент - смотрим там же, т.е. в replmon

Перед понижением второго контроллера командой dcpromo попробуйте выключить его и поработать без него. Если все ОК (а это означает, что и ошибок в логах нет), то можно сносить с него АД.

Перед всеми процедурами рекомендую почитать об АД в networkdoc.ru или где-либо еще.