00101045041040
на флешку закатал command и еще что-то, флешка стала загрузачной.
Скопировал на винт инстал ОС и сетапнул его с винта.
В итоге всё равно на флешку пишет.

А проблема видимо как я и раньше предпологал в Буквах.

А если не получится, какие еще варианты есть?
Проблема в том что ты не читаешь рекомендации которые тебе пишут
или не делаешь все пункты которые тебе написали надо сделать

рекомендую почитать очень вниматеьно в следующей статье разделы
"Подготовка жесткого диска к установке Windows 98"
"Разбиение жесткого диска на разделы"
http://support.microsoft.com/kb/221829

как я понял что HDD всётаки удалось форматнуть под ФАТ
уже хорошо
загрузившись с флешки
1.надо дать команду SYS Х: где Х буква диска HDD
2.перейти на HDD
3.дать команду MD Win98
Затем перейти на флешку в папку, содержащую установочные файлы Windows 98, введя:
буква диска:\название папки (в твоем случае это наверно будет например, С:\Win98).
и скопировать установочные файлы Windows 98 в созданный временный каталог, введя команду:
Copy *.* Х:\Win98
4.После того, как все файлы будут скопированы, выдернуть флешку и перезагрузить комп в режим Safe mode command prompt only
5.После перезагрузки
дать команду win98\setup
ЗЫ внимателно изучи ссылку на МС где описыватся работа с FDISK

00101045041040,

извини если тебе показалось что был резок
вопрос в том что я же просто вижу что народ даёт рекомендации и по тому что ты пишешь одназначный вывод - делаешь не всё что реомендуют

ЗЫ всё таки почитай по Fdisk и не забудь при загруженной флешке сделать SYS диск:
при том было бы полезным увидеть результаты твоих действий прямо по пунктам как было расписано
если что не так сразу пипл это увидит

сыпополитологчего то команды SYS я не нашел
Скачай с инета образ загрузочной дискеты ДОС и отпишись что ты там нашёл