Дело не в самом по себе "Администрировании" а в знании архитектуры системы.

IIS.. с ним сталкивался мало. Нормальной документации так и не нащёл. Только на сайте Microsoft`а несколько статей. У них очень много меняется от версии к версии.
Ссылки на IIS:
IIS 6 http://technet.microsoft.com/ru-ru/library/cc785089(WS.10).aspx
IIS 7 http://technet.microsoft.com/ru-ru/library/cc753198(WS.10).aspx

По секурности и AD - скачай книжечку по Windows 2003 Server и прочитай соответствующие главы. Их очень много, советовать что-то конкретное не стану, я думаю тебе "для общего развития" это не принципиально. После прочтения, у тебя уже другие - более узкие - вопросы появятся.

По сетям... это очень большая тема, что конкретно тебя интересует?
Опять же, почитай\посматри книги по Windows 2003 Server. Скачай три-четыре и посматри там что про
сети пишут.

А также TechNet на всё том же microsoft.com. Да и гугл очень хорошо по microsoft.com ищёт.

Я бы посоветовал обратить внимание на статьи посвященные безопасности WEB ресурсов. Лог на диске C:\ (системном?) и права записи на него для NETWORK SERVICE...