Dima TКак вариант: вроде можно выделить кучку файлов и дружно отправить на печать. Для печати поставить PDF-принтер.
Со своей колокольни (подручными знакомыми мне программными средствами), я бы сделал так:
1) конвертанул бы pdf->tiff используя ghostscript
2) слил бы TIFF-ы в один (как раз решал такую задачку недавно 21684891 )
3) воспользовался бы утилитой tiff2pdf.exe (из комплекта libtiff)
(2) и (3) - считай мгновенно, на (1) как впрочем и на "печать" уйдет таки "какое-то время".

Недостаток таки есть существенный. Как и в случае ghostscript, так и в случае "печати" (да хоть бы сразу опять в pdf) на выходе получим картинку, а в исходных pdf может быть например текст и т.д.

Либо копаться в спецификации pdf (что вряд ли оправдано), либо действительно найти какой-нибудь готовый tool, если очень надо то можно думаю и бесплатный OpenSource какой-нить найти, вон люди ссылки вроде привели.