rownong27- делать выгрузку дампа БД MySQL и ее архивациюmysqldump + gzip
rownong27- архивация директории (файлы и папки)tar
rownong27- архивы отправить на хостинг файлов (Яндекс Диск, Google Диск)Настроить правильно демон yandex-disk, запустить, остальное он сам сделает.
rownong27- после отправки архивов удалить их с VPS сервераПрочитать состояние об успешном статусе синхронизации из yandex-disk, затем удалить файлы.
rownong27Может ли сделать это php-программист без помощи системного администратора?Вполне сможет, если только умеет читать и понимать мануалы, в состоянии освоить штук пять довольно распространенных команд и написать небольшие шелл-скрипты.

Да можно и на PHP. Нет большой разницы, чем управлять. Из PHP отправляете системную команду, получаете ответ, обрабатываете результат. Инструментов для работы с системой есть выбор: http://php.net/manual/ru/ref.exec.php
Другое дело, что PHP не вполне приспособлен под подобные задачи, код получается обычно более громоздким, нежели на шелл.

Dimitry SibiryakovШелл требует включения CGIНафига CGI, когда "на *nix ОС" шелл есть из коробки. Пишем скриптики, стандатрно вешаем их на крон. А про "стартовать бэкап по нажатию кнопочки в веб-морде" ТС ничего не говорил.

Dimitry SibiryakovPS: Осталось только найти PHP-программиста.Скорее, осталось найти, с чем в этой задаче без PHP ну никак не справиться.

Могут. А ещё и tar -z оттянет на себя ресурсы ВПСки. Только, чтобы блокировки стали проблемой, нужно к гигабайтам данных в базах добавить требования по высокой доступности сервера. Что не очень-то согласуется с "бэкапами на php" на, скорее всего, никем не администрируемом сервере. Иначе бы не спрашивали про необходимость привлечения системного администратора к этой работе.
Тем не менее, разумное решение - запуск бэкапов в три часа ночи, когда потенциальные пользователи могут и подождать пару минут.