vangofЭто совершенно разные, с точки зрения аппаратные платформы и они в принципе не совместимыя бы не был столь категоричен. насколько мне изместно платформы имеют почти полную обратную совместимость.
С Linux не приходилось проводить подобные мероприятия, однако был успешный опыт живой миграции с 32 бит на 64 на FreeBSD. Там процесс выглядел примерно так:
- были скачаны исходники 64-х разрядной системы
- пересобраны ядро и мир
- после загрузки в 64-х битном режиме весь софт, который был 32-х разрядный работал корректно(но либы 32-х разрядные не удалялись на этапе установки мира)
- для чистоты был пересобран весь софт уже на 64 бита

При этом для некотрых дистрибутивов миграция описаны прямо в документации , поэтому советую поискть несколько внимательнее