Проблема не описана достаточно ясно. Но в замечаниях по реализации Eclipse 3.1 сказано, что она несовместима с экранной темой Bluecurve в RedHat (которая и в Fedora основная), и рекомендуется использовать другую.

мой ответ старый, теперь я повыяснял
- у меня в Fedora 4 зависание было только при работе как пользователь root. При запуске от лица обычного пользователя, запускается.
- но без толку. Оказавшийся в комплекте дистрибутив Eclipse 3.1M6 оказался настолько глючным, что для работы нне годится. Причём естественная глючность отягчается тем, что дистрибутив приспособлен для GCC вместо JDK от Sun. И там есть ещё некое JRE 1.4.2_0. Не понял, что это такое (некогда было смотреть). Если от IBM, то фтопку. То есть, посмотрев, как это работает, можно списать Sun JDK 1.5 и стандартную Eclipse 3.1. Это тоже помогает (не испытывал), только надо учитывать предупреждения об установке Sun JDK из .rpm (не рекомендуется). Подробнее было обсуждение на форуме www.linuxquestions.org

Большую часть глюков FC4 удалось устранить, сменив GNOME на KDE, хоть и не хотелось. Можно было бы списать более новую версию GNOME, но оно большое.


JRE от IBM - ни к чему. Если в программе будет глюк, то каждый раз придётся думать, ты ли виноват, или нестандартное JRE.