Поидее, если скрипт принадлежит определенному пользователю (по его ID), и пермиссии запрещают visitor'у чтение, то другие пользователи не смогут их читать и выполнять. Чтобы пользователи не смогли прочитать исходник но могли запустить скрипт - просто сделай так, чтобы они не смогли прочитать его через ftp (потому что через http читать исходники php невозможно). Сделать это в ftp-демоне очень просто. А через функцию file пользователи со своих скриптов не смогут прочситать чужие скрипты, если РНР в безопасном режиме. Поэтому поставь безопасный режим и можешь быть спокоен.

(извините за тавтологию, я наскоро писал сообщение)

SHOGAL