качественно поиск в текстовых файлах делают соответсвующие утилиты...

поэтому вопрос можно смело перефразировать - а как из пхп вызвать скрипт на шеле и передать туда ещо параметры... да легко. exec() и функции которые рядом найдёшь

у меня например стояла задача, имея список файл - мд5, получить список файл-мд5 файлов на сервере, и сравнивая файл как должно быть и что есть по факту, сформировать списки
пропавших файлов, лишних файлов, битых файлов.

можно на пхп конечно страдать на несколько милионов мелких файлов, но зачем - когда задача решаеться довольно просто на шеле.

или стянуть логи за интервал дат со всех нод и найти все ошибки определёного типа...тоже на пхп зачем страдать если на шеле вообщето в одну строку можно решить(на мониторе это три строки текста) но как одна команда шла... а главное быстро