ChopСтою перед дилеммой, на чем поднять WEB-server, под виндой или Red Hat?

Окромя стандартных задач (сайт) предполагается написание своего TCP-сервера,
чтобы от удаленной железяки принимать данные и пихать их в MySQL.

Какие есть мнения?
Начинать надо как раз со "своего _TCP_-сервера". Зачем вам такой изврат вообще нужен ?
Если уж ваша железка умеет Ethernet + TCP/IP, то наверняка проще будет использовать для передачи своих данных какие-то стандартные, обкатанные и легко диагностируемые протоколы - HTTP, SNMP, rSyslog, *Flow и прочее. Зачем ещё один велосипед ?
Поверьте, отладка самописного бинарного протокола, стимулируемая наркотическим дымом от раскуриваемых дампов траффика - исключительная муть и мерзость.

Что касается веб-сервера - тут линукс совершенно однозначно.

Причины:

1). Гораздо проще в плане виртуализации / смены типа виртуализации и прочего. Вы вспомните об этом, когда от вашего веб-сервера потребуется повышенная отказоустойчивость и вы захотите быструю живую миграцию.
2). Есть механизмы усиленной защиты. Да, я о SELinux. Если только ваш веб-сервер не делает чего-то экстраординарного (типа общения с ядерными реакторами и военными спутниками по нетривиальным протоколам :D), нет никаких причин отказываться. Фильтрация системных вызовов в ядре - страшная сила.
3). Гораздо более надёжное и _прозрачное_ в плане аудита управление. SSH с авторизацией по ключам + оповещения на почту/джаббер о каждом логине - это гораздо удобнее и секурнее для веб-сервера, чем доступ по RDP/VNC/TeamViewer и прочее.
То же самое касается доступа для файловых операций.
4). Легковесность системы.
5). Аптайм можно получить заметно больший, хотя меряние аптаймами - тот ещё холиварищще =)
6). Потребуется утащить в облако/хостинг/прочее-впс-нутое - в случае с линуксом выйдет сильно проще и дешевле.
7). Написанное на php / python можно с линукса утащить на фряху, линукс или даже виндовс с минимумом усилий. Причем если проект писали не совсем укурки - то ещё и на довольно широкий диапазон версий. Написанное же на каком-нить асп-дот-нете в большинстве случаев проще выкинуть, чем куда-то перетащить.

Ну вот как-то так.

P.S. И это - с самописными tcp-серверами не балуйтесь лишний раз без крайней на то нужды =)