$_FILES, $_POST, $_GET, $_COOKIE
появились на смену
$HTTP_*_VARS

они в отличие от $_HTTP_* - глобальные (то есть для не надо в функциях делать global)
ИМХО лучше (и удобнее) использовать их.
Например в php.ini появилась возможность (если я ничего не путаю) отключать создание переменных $HTTP_*

А не работает у тебя под линухом скорее всего из-за того что старая версия установлена

то есть под линухом работает $HTTP_POST_FILES а $_FILES не работает ?

хмм, а что выводит
print_r($_FILES) ?

ps
я с таким не встречался, может баг или ты чего-то не заметил