<?php
$file = dirname(__FILE__)."/".$file;

if (file_exists($file)) {
   if (ob_get_level()) {
      ob_end_clean();
    }

    header('Content-Description: File Transfer');
    header('Content-Type: application/octet-stream');
    header("Content-Disposition: attachment; filename=".$file);  
    header('Content-Transfer-Encoding: binary');
    header('Expires: 0');
    header('Cache-Control: must-revalidate');
    header('Pragma: public');
    header('Content-Length: ' . filesize($file));
    readfile($file);
    exit;
  }

?>

/*здесь заменил просто на имя файла, т.е. без пути, и все стало на свои места */
header("Content-Disposition: attachment; filename=".$filename);