чтобі получить данные по сабмиту формы, эти данные нужно записать в эту форму.
например создай там hidden-поле
и скрипт
<form method="post' ..... onsubmit="return postArray();">
<input type="hidden" name="hdn" value="">
....


<script language="javascript">
function postArray() {
for (i = 0; i < array_of_files.length; i++) {
document.form.hdn.value += ' '+array_of_files ;
}
return true;
}
</script>

примерно так. В ASP-скрипте из hdn возбмешь все пути, написанные через пробел.
Скрипт конечно не тестировал - скорее всего он не работает :-)