1). Нужно написать php-скрипт, который подключается к базе данных, запрашивает нужные Вам данные в переменные, а затем формирует html-страничку, которая использует эти данные. Т.е. все, что выводит этот скрипт является html-кодом. Скрипты лучше всего писать ручками, в блокноте.
2). JavaScript стоит использовать только для "примочек". Т.е. если Вы хотите, чтоб при движении мышки менялись какие-либо картинки, или если Вам нужно написать проверку данных, введенных в форму на компьютере клиента, и т.д. Если Вы в этом не сильны, то освойте сначала php+sql, и только потом подключайте JavaScript. JavaScript пишется либо в отдельном файле, который подключается в html-страничку, либо он включается непосредственно в страничку (т.е. формируется и выводится php-скриптом).