vkleВ логах апача вижу код ответа сервера 404. А открывается при этом главная. Верно? Это модикс формирует 404 код, так получается. Тогда вебсервер тут ни при чём. Смотрите движок, настройки сайта, имена страниц, алиасы, что там ещё есть...
Ну, или вебсервер _ну_очень_криво_ настроен.

Да, я когда пробовал сайт на modx развернуть тоже на проблему ЧПУ нарывался. Не помню уж как решал (было больше года назад). Но это было нечто... Я тогда около дня на решение этой проблемы потратил (хотя опыт активной разработки к тому времени лет 5 был).
Результат работы: развернуть полноценный сайт так и не получилось (сложный сайт с каталогом сериалов и разного рода фильтрами, оценками и т.д.). В итоге работу выполнить не удалось и пришлось выбирать другой движок (в частности всё же склонили заказчика на написание сайта на базе Yii и создания CMS строго под него со всеми плюшками). Повезло с понимающим заказчиком, да и проект вырос в нечто ещё более глобальное.

Вывод: с modx работать больше не буду. Написание собственного модуля для этой CMS выливается в целую проблему (если не ошибаюсь добавление собственного типа документа обходится в десяток строго структурированных файлов сильно переплетённых с API системы). То есть инструмент не предназначен для доработок и модификаций в принципе.

Может не прав, но моя рекомендация - есть много более удачных движков с намного меньшим порогом входа... Взять тот же wordpress. Я на нём простенький сайт каталог собрал и создал и заверстал собственную тему (с разного рода настройками) за день ни разу до этого не работая с этой CMS. Он имеет очень низкий порог входа и снабжён достаточной документацией.