AreostarИнтнресен также вариант когда вторая программа находится на другом сервере.Согласен, интересная штука. Для этого варианта требуется предварительная подготовка серверов и базовые знания в области администрирования.

Areostarcurl не подойдёт?Ну а как его прикрутить...man curlDESCRIPTION
curl is a tool to transfer data from or to a server, using one of the supported protocols (DICT, FILE, FTP, FTPS, GOPHER, HTTP, HTTPS, IMAP,
IMAPS, LDAP, LDAPS, POP3, POP3S, RTMP, RTSP, SCP, SFTP, SMB, SMBS, SMTP, SMTPS, TELNET and TFTP).Если только программу на удаленном сервере запустит кто-то, к кому можно постучаться и вернет ответ. В принципе, как альтернатива ssh, конечно. Только на удаленном сервере вместо штатного sshd придется что-то свое мутить.
Конечно, для случая, когда удаленный сервер не имеет штатно шелл-доступа (винда, например), это может оказаться вполне годным вариантом.

Areostarну а если на одном сервере?Ну тут как мыслю... Если проект гарантировано без расширения "зоны влияния" на другие серверы - так и базового пхпшного функционала по вызову шелл выше крыши. А если этот сервер будет одним из многих, к кому придется стучаться - то и обращаться к нему как ко всем остальным, "через внешку". Для стандартизации, так сказать.

Areostar,

В мануале примеры посмотрите.