mrio_15,

Судя по вашему коду: $(document).height() - у вас список сообщений чата прямо в body?
Если в диве с прокруткой, то надо брать высоту этого дива.

Вам нужно прочитать про встроенные методы obj.getComputedStyle() (obj.currentStyle() для старых ИЕ),
Получить высоту height, если вернётся значение "auto", то тогда уже проверять для кроссбраузерности так:
var my_height = (obj.offsetHeight > obj.scrollHeight) ? obj.offsetHeight : obj.scrollHeight;
Затем менять obj.scrollTop
------
где obj - ссылка на элемент со списком сообщений (например div или body - где там список у вас выводится)

Поправка: возможно неверно указал синтаксис getComputedStyle (подзабыл, давно уже пользуюсь написанными функциями).
Вместо obj.getComputedStyle()
можно воспользоваться разными вариантами:
var my_height = window.getComputedStyle(obj,"").height;
var my_height = document.defaultView.getComputedStyle(obj, "").getPropertyValue('height');