rabiterrabiter,

Кажется я разобрался. Под хромом нумерация таймеров начинается с 1.
т.е. первый вызов на страничке alert(setTimeout(...)) вернет 1, второй 2, 3 и т.д.

в FF же нумерация почему-то начинается с 2, минуя 1.

Сдается мне что какой-то левосторонний яваскрипт тупо вызывает clearTimeout(1) (страничка работает в рамках фреймворка JSF IceFaces, так что не всегда понятно что там за javascript еще помимо нашего выполняется).

Вообщем в итоге я попробовал сделать так:
var toId = setTimeout(...)
clearTimeout(toId).
setTimeout(...)

т.е. пропустил первый таймер.

И все сразу стало работать.

Может в таком случае выкинуть "фреймворк JSF IceFaces" )) Просто такое нездравое поведение - это ненормально. Или ты в чём то ошибся, или авторы не подумали о совместимости с другим кодом.

Вот например гугловцы. У них есть насколько я знаю 2 ограничения: их код всегда первый на странице и стандартный объект не должен расширяться. Вот это здраво.
Просто если фреймворк сам удаляет таймеры по номеру - он и анимацию любую прервать может, и что угодно ещё испортить). И не факт, что он объекты стандартные не расширяет, а это возможная ошибка при работе с гугл-приложениями (ну и т.д.)