Диалоговое - на то и диалоговое, чтобы быть выше всех окон. Я так понимаю, что речь идет о псевдомодальном окне? Какой плагин?

О, нашелся мембер, а то гостю отвечать несподручно :)
Нет, насколько помню, в их библиотеке диалог z-index настолько большой, что перебить сложно.

Идеологически также этот вопрос не должен так решаться, так как диалог - он и в Африке диалог - он должен взять на себя как внимание юзера, так и весь фокус контекста. Отвечаешь (закрываешь) диалог - получаешь окна дальше. Более того, у диалога наверняка есть колбек, который после себя может вызвать то, что требуется.

Так что не выдумывай, это неправильно. Либо создавай свои окна, которые, правда, нельзя назвать ни диалоговыми, ни модальными, в силу их смысла ...

Извини, но это уже не далоговое окно, а информационное. Не забывай, что ты все это делаешь на странице, а не в клиентском приложении, соответственно, рамки значительно уже.
Библиотека диалог таких возможностей не предоставляет.

Опять-таки, по памяти, существует 3 типа диалоговых (модальных) окон - message, confirm, select. Соответственно, в первом одна кнопка типа "закрыть", во втором - две "Ок" и "отменить", и в третьем - 3 кнопки "да", "нет" и "отменить" (последняя обычно как "нет"). А вот чтобы еще что-то делать - или ищи другую библиотеку, или полностью переделывай эту.