Никак. Разбивайте данные на несколько таблиц.

Таблица должна быть конкретной фиксированной ширины, чтобы помещалась на лист бумаги.
1) Создаешь новую пустую невидимую таблицу с теми же параметрами, что и таблица с данными. Для надежности можно добавить ей стиль page-break- after :always.
2) Добавляешь в нее шапку.
3) Получаешь все строки таблицы с данныыми, перебираешь их до строки, offsetTop которой (или clientTop, не помню точно) выходит за границу очередного листа. Пиксели нужно переводить в миллиметры и сответственно запоминать уже отсчитанную высоту, учитывая поля листа и высоту шапки.
4) С помощью cloneNode создаешь аналогичные строки и добавляешь в новую таблицу.
5) Повторяешь пп 1-4 для каждого блока.
6) Перемещаешь созданные таблицы перед исходной, отображаешь, а исходную прячешь или удаляешь.

Есть другой вариант. Можно добавлять шапку в нужное место таблицы.
П. 3 остается неизменным, вместо всех других операций делаешь следующее: создаешь новый thead или tr шапки (в зависимости от ее кол-ва строк), помещаешь его в таблицу и перемещаешь в нужное место с помощью moveRow. И опять таки для надежности добавляешь page-break- before :always.

Более простой способ придумать не могу)

Нечто похожее я уже делал, но у меня строки были фиксированной высоты и не было шапок.
Нужно было раскидать таблицу на несколько листов этикеточной самоклейки, чтобы каждая ячейка четко попала на этикетку.