Немножко непонятный топ ... это, надо полагать, вопросы и просьба посоветовать?
Тут каждый может ответить только, что ему ближе к душе и с чем ему лично приятно работать. Нет единого подхода и нет единых предпочтений.

По себе:
1. Использую eclipse как для html-верстки, так и для серверной части (java) - есть подсветка тэгов, ошибок (правда, для html тормознутая, а для javascript отсутствует - надо искать плагины).
2. html + css + javascript (dhtml) - это только клиентская часть - фронтсайд. Без серверной (бэксайд) в большинстве своем это забава и способ поучиться верстать странички - ИМХО.
3. прдн, не скажу, но этого в инете - тьма тьмущая, бери Гугл и вперед ... Главное всегда - знать, чего хочешь добиться, иметь сценарий страницы/сайта и желательно иметь дизайнерское представление страницы/сайта - это дело художника-дизайнера.
4. Тяжело говорить за бесплатные графические редакторы, когда есть Фотошоп с креком ... лучше пока никто ничего не придумал, а опыта у большинства в нем - годы ...
5. Пошаговая реализация, постоянное натыкание на проблемы, с МСДН не вылазил - на каждом шаге возникали вопросы, постоянный поиск в Гугле - наблюдательность и желание учиться сделают свое дело, опыт прилепится. Просто надо знать, что это - не мимолетное увлечение и что одной страничкой дело не закончится.
6. Для PHP из навалом - Гугл рулит, для Java - практически нет, для более специфических, типа ColdFusion - даже платные поискать надо. То же обстоит с базами данных - MySQL и PostgreSQL сплошь и рядом, а MS SQL Server - дорого и сердито. Надо все искать "под себя" и смотреть отзывы и обзоры.

Удачи!