Не совсем понятно, что значит "закрыть флеш" ... это как "закрыть див" или "закрыть чекбокс" ...
Поэтому не думаю, что смогу помочь, так как писать о всех вариантах, о которых могу подумать, не хочется, хотя ...

1. Избавиться от флеша на странице. Просто удалить содержимое контейнера, в котором находится флеш (обычно флешки помещают в дивы, чтобы можно было управлять расположением в слоях и кроссбраузерным помещением флеша на страницу).
2. Прервать загрузку прелоадера/анимацию загруженной флешки. Без изменения кода прелоадера или флешки невозможно, но управление со странице вполне. И вообще, возможное полное двунаправленное взаимодействие javascript и ActionScript 3 с помощью класса (в AS3) ExternalInterface - явно серьезное продвижение флеша в этом вопросе после поделок и возни с getURL, fcommand и т.д. (мог ошибиться в написании - уж больно давно с этим возился).

Однако все-таки напиши более конкретно, что ты хочешь сделать с флешкой.

Понятно. Тогда просто удаляй содержимое контейнера, а GC закончит "уборку" флеша сам.