Если хочешь именно .Net, то другого выхода нежели поставить в начале VS2003 не вижу. Ну а затем запускаешь "студио" заходишь во вкладочку с си шарпом и далее выбираешь SmartDeviceApplication - вот вообщем-то и всё. Дальше - программируешь.
Если кпк у тебя не под PocketPC2003, то поддержки в нем Compact Framework'a нет и тогда тебе нужно его установить... В состав Visual Studio 2003 дистрибутив этого счастья не входит - CF качаем отдельно (~3Мб). (Правда есть ещё вариант: пользуемся создателем инсталяторов типа Wise и включаем в инсталятор компакт фрэймворк для конкретной модели процессора [arm,mips,etc.], либо для всех сразу.)
В MSDN под VS2003 есть подробное описание Compact версии Framework'а: опирайся на него, да и отличий практически никаких нет от полноценного C#, только что возможности урезаны немного (мягко говоря).
Прикол в том, что если не пользоваться всякими там оригинальными пространствами имён в CF, то этуже программу, без доп. компиляции, можно будет запускать и на ПК, в противном случае: exception :-) Но не наоборот.
Удачи.
Будут вопросы: smath@yandex.ru...