автор хочешь с помощью C# развёртывать приложения в домене?
или автор хочешь программу на С# развернуть в домене?
но вообще, при любом раскладе автору надо идти учить Group Policy Management

VADKINZRoman Mejtes, с помощью C# развёртывать приложения в домене
для развёртывания приложения в корп. сети существуют доменные политики.
но если сильно припёрло именно на C#, то делать нужно так:
а) скопировать установочные файлы во временную папку удаленного компьютера
б) авторизоваться на сервере с правами админа
в) установить службу установщик (которую надо тоже написать, можно и на C#)
г) запустить службу
д) дождаться когда служба выполнился и остановится
е) удалить службу.