razlivЗанимаюсь ETLом Microsoft Dynamics и есть потребность синтегрировать
код на C# которые извлекает массив обьектов Entities и передает коду
на Java встроенный в Informatica JVM.

Каким образом/ с какой технологией интегрируеться С# и Java код,
Какой подход удобен в данном случае?

Тут не интеграция кода, а передача данных из одной системы в другую.
Как?
Зависит от конкретной задачи и возможностей.
Можно, например, вообще ч/з файловую систему в файлах передавать.

А так самый простой способ это ч/з REST-api JSON.
Чуть сложнее, но зато с более сильной типизацией это SOAP-сервис.

Можно долго/дорого/глюкаво через какою-нибудь ESB...

Последнее рекомендую только если откатоемкость решения будет очень большим. :-)