Ответ, на Ваш, вопрос лежит в Ваших потребностях. Если требуется распределенная система с возможностью коммутации с стронними приложениями написанными на других языках, то Ваш выбор Web-Service и Soap(XML) или же если Ваша система хочет предложить такой сервис, альтернативой для интеграции с сторонними приложениями может послужить MSMQ из Com+. Если платформа только Net, то используйте Net Remoting, останется выбрать протокол(HTTP подойдет для доступа через WEB, TCP для интранет приложения), последний позволит Вам, использовать бинарный форматер при сериализации объектов, что положительно скажеться на скорости, работы Вашего приложения. По личному опыту, предпочитаю именно эту связку Remoting + TCP + binaryfofmater. К сожалению, не всегда это возможно(файрволы, требование доступа через Веб и.т.д).C ув. Сергей. 
История - это огромная система раннего предупреждения.
Norman Cousins