На производительность особо не влияет, потому что все фичи тем компилируются в сборку и последуюшее их использование идет уже из них.
Лучше использовать механизм тем, это позволит упростить поддержку сайту.
Темы тут вообще ни при чем, они никак не влияют на размер страниц, а вот вынос дизайна в .css-файлы гораздо облегчает страницы, к тому же эти файлы очень плотно кешируются и соответственно снижается трафик.