Действительно, считать когда он пришел и когда ушел - смысла нет ни какого. У нас это интегрировано с пластиковыми картами. Дверь открыл - значит на работе. Но подсчет никто не ведет - как говорилось смысла нет.

На мой взгляд более правильным было бы видеть чем работник занимается и когда освободится. Это очень удобно для планирования. точность не очень высокая, но хотя бы ориентировочно видно. для этих целей можно конечно заюзать MS Project, но практика показывает, что это все вести - это отдельная работа.

Так что для начала лучше определиться - что Вы хотите получить.
Просто считать опоздания на работу?
Если только это, то действитеьльно, надо что-то самое простое - одна таблица + веб интерфейс.