Странички в поддиректории IIS не обрабатывает вообще - выдает заглушки. В то же время виртуальная директория сконфигурирована - что видно на рисунке. Ну и переадресации, конечно не происходит.

На самом деле я бы хотел сохранить корневым каталогом приложения "~" для всех страниц (в том числе страниц в поддиректориях), а виртуальную директорию я IIS делал просто от безвыходности - просто не пойму как победить эти сообщения.

А слово это allowDefinition - оно встречается множество раз в MachineConfig - тоже непонятно зачем и на что его надо менять.