Я, вот, честно, никогда не понимал пассажиров, которые деплоят апп прямо из вижуал студии. Круче может быть только ставить саму VS на продакшен и запускать там приложение только из неё. Что мешает делать "dotnet publish -c Release -o .build", а потом просто копировать папку .build куда угодно и каким угодно способом? А, по хорошему, все это вообще должен делать билд-сервер в автономном режиме.

Ну, дело вкуса, мне, лично, наоборот, понятней папку .build по тому же FTP скопировать на сервер, чем гадать - что же там студия у себя в недрах делает.