...
     // Список участков из Entity
      var query = entDataSet
                     .ZR_TERR
                     .Select(x => new
                                       {
                                           x.ID,
                                           x.CAD_QUART,
                                           x.CAD_NUM,
                                           x.SQUARE,
                                           x.CATEGORY_ID
                                       });

// Здесь в Watch query.Count() = 150;

...   
     // Фильтр по полю CATEGORY
         query = query.Where(x => param.filters.ListCategory.Contains(x.ZR_CATEGORY_ID));  // List<int> param.filters.ListCategory - ID из справочника CATEGORY

// Здесь в Watch query.Count() = 100;

     // Фильтр по маске номера
         query = from c in query
                    where SqlMethods.Like(c.CAD_NUM, param.filters.ListCadNum[0])
                    select c;

// Здесь в Watch query.Count() уже не определяется. 
// Выдает: LINQ to Entities does not recognize the method 'Boolean Like(System.String, System.String)' method, and this method cannot be translated into a store expression.

delegate bool CadNumsFinder(string CadNum, List<string> Masks);

CadNumsFinder finder = delegate (string CadNum, List<string> Masks)
{
  foreach (string Msk in Masks)
  {
     Regex rx = new Regex(Msk.Replace("?", ".").Replace("*", ".*"));
     if (rx.Match(CadNum).Success)
        return true;
  };
  return false;
};

query = query.Where(x => finder(x.CAD_NUM, param.filters.ListCadNum));