msleg,

У нас используются:
связка Visio(сам интерфейс/с переходами, итеративностью)/Word(описание общий документ) для простых/дешевых/стандартных интерфейсов и проектов.
(пишет и рисует/проектирует аналитик на основании общих требований по факту примерный "sketch", без привлечения дизайнера, много на усмотрение разработчика 2-1 [тоесть ели разработчик скажет, что это сложно и долго, то в корзину], интерфейс особо не меняется в процессе разработки, закреплен на начальном этапе)

(axure vs sketch)интерфейс/pdf(документ) (пишет готовит аналитик с привлечением дизайнера, часто выделен отдельный верстальщик в случае с web, учитываются пожелания всяких отделов заказчика, но основные моменты определяются на начальных этапах) - средние проекты.

Gimp/Photoshop/coreldraw/jira(прямое общение с заказчиком ) - никаких документов! - (аналитик только записывает со слов дизайнера "брендинг/общую story и.т.д." и соотнося с требованиями, часть вообще рисуется от руки, как комиксы, поменяться всё может в ночь по хотению PR - отдела - прямое взаимодействие с заказчиком) - дорого.

Со самому ТЗ:
Нужен ли интерактивный прототип? если нужен, то в ТЗ только ссылка на него, вырезать отдельные экраны в ТЗ не рекомендую.

Если интерактивности не требуется, то если кратко, сначала описываются элементы интерфейса, кнопки, фильтры, элементы поиска и сортировки и общий вид. Вероятно у интерфейса будет то или иное меню которое удобно описывать в виде дерева и уже далее описывается частно каждый экран в зависимости от соглашений вплоть до примеров запросов в БД при необходимости.