30+Не совсем так... В идеале, мне это видится следующим образом. Заказчик (начальник и т.п.) описывает мне софтину простым человеческим языком. Типа, нужно чтобы софтина делала то-то и то-то и выглядело это (внешне) так-то. Я составляю алгоритм и реализую его, причем делаю это не только на Java (потому что я знаю, скажем, только Java), а на том языке, который больше всего подходит для решения данной задачи (в пределах разумного, естественно). Теперь стало понятнее. Вы хотите освоить полный цикл разработки ПО. Тут действительно нужно двигаться поэтапно, но на детальное изучение всего процесса уйдет лет так несколько.

тыцрешайте олимпиадные задачки по информатике + чтиво по алгоритмам, эти вещи сильно голову ломают... хотя имхо надо хотябы склонность к этому иметь... Очень верное замечание в плане развития алгоритмических навыков. Правда, я бы еще усилил требования: взять любую классическую задачу, алгоритмы решения которой уже изъезжены вдоль и поперек, и дополнить чертами из реальной жизни.
Например, в задаче Коммивояжера, кроме дальности маршрута можно учитывать и фактор стоимости переездов. Проблема представляется совсем в новом свете!
Вообще, думаю, тут больше поможет не теория, а практика. Попробуйте прогнать несколько собственных небольших проектов: сделать ПО, нужное лично вам (например что-то вроде классификатора заметок или менеджера паролей - разумеется, задачи должны быть требуемого уровня).
"Узкие места" сами укажут направления дальнейшего совершенствования!

grexhideзашоренно бесполезный матан, которым до потери вменяемости пичкают на специальностях Прикладная математика Матан на полную мощность работает в физике. Вот где потребуется весь его аппарат для моделирования реальных процессов.
Помню на 2-м курсе в РГР у нас были физические задачки, которые сводились к составлению единственного интегралла и его решению. Причем решить его особого труда не составляло, а вот СОСТАВИТЬ...
Тут как раз и требовалось весьма развитое системное мышление! Большинство студентов выло!
(Я, кстати, закончил институт как раз по ПМ, и ничуть об этом не жалею).