Мало данных.

Какого порядка? Затухание, неравномерность?
С фиксированными частотами среза или с возможностью регулировки?

Про ДПФ и обрезание спектра не слушай - это они издеваются. Получишь на порядок больше вычислений (не по сложности, а по количеству вычислений на единицу твоего дискретного временного отрезка)

Алгоритмов классической фильтрации 2 - с обратными связями и без. Все они основаны на линиях задержки отсчетов и алгоритм смехотворен. Структуры фильтров (ФНЧ, ФВЧ, ПФ) одинаковы, все решают коэффициенты фильтра.

Также, могу поделиться алгоритмом приближенной фильтрации, весьма эффективной в случае, когда в ходе фильтрации частота фильтра должна "плавать".

Уточни, что именно тебе нужно.