В моем случае в тех конфигах что хранятся на клиенте, нет ничего что может как-то принципиально поменять функциональность, и соответственно, никаких версий и тем более веток от них не требуется.

Обычно секция=форма а параметр - это значение соответствующего контрола на форме, в ряде случаев - опосредованно.
Добавился контрол или еще какая-то штука которую нужно сохранять между запусками программы - добавился параметр в ini.
Если там его не было - подставляется умолчание зашитое в exe.
Если параметр был но потом упразднили - то он остается в ini в виде ненужного мусора. Однако этот мусор позволяет без проблем откатиться по версиям exe назад :)

При изменении в базе я загружаю в нее же новую версию программы, и при старте приложения оно самообновляется и соответствует "геометрии".
Если изменения критичны - то делаю это ночью и отстреливаю коннекты тех кто не закрыл программу на ночь, что бы утром они точно обновились.
Именно поэтому я против каких-то то там универсальных инсталляций программы на всех сразу.
Каждой базе - своя версия приложения, взятая из этой базы.

Не уловил к чему это относится.
Тот случай когда цитирование было бы очень к месту.