Владимир Г....InstallShield 2010. ...подключаю merge module ...после билда все DLL-ки распаковываются и ложатся в папку с сетапом ...Есть ли возможность как то запаковать эти DLL-ки?

1) merge module это способ инкапсуляции разработки сторонними фирмами по отношению к вам. как правило со сборкой ассоциируют одну из фич. и от этого способ сборки никак не зависит.
2) есть разные способы создания результата сборки проекта. этим заведует раздел release в дереве вашего солюшена. далее запускаете визард и на вкладке по упаковке готового билда выбираете экзешник (если вы юзаете лаунчер) либо msi в который упаковываются все файлы. при этом есть возможность выбора - например только msi или msi и куча кэбов, которые в свою очередь могут создаваться по имени фич (к примеру).
3) так же надо понимать, что один и тот же солюшен может иметь разные условия и правила сборки. т.е. в одном солюшене вы можете создать несколько различных сборок под разные условия вырезая фичи флагами которые можно указать при сборке(как пример). Например Вы определили фичи под x32 & x64 оси. По првилам MSI их нельзя создавать в одном MSI. Но если Вы одним фичам укажите флаг "x64" а другим "x32" а третим "x64, x32", то в настройках релиза вы можете "набирать" этими флагами необходимый список фич. Правда для x64 надо ещё изменить вид всего солюшена (в главных настройках) но данный пример больше как пример (хотя и боевой) :) .


удачи вам
(круглый)