Не могу добиться!
Вот исходник:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE dmodule [
<!ENTITY ICN-30-A-320000-0-00000-00001-A-01-1_001 SYSTEM "ICN-30-A-320000-0-00000-00001-A-01-1_001.cgm" NDATA cgm>
<!ENTITY ICN-30-A-320000-0-00000-00002-A-01-1_001 SYSTEM "ICN-30-A-320000-0-00000-00002-A-01-1_001.cgm" NDATA cgm>
<!ENTITY ICN-30-A-320000-0-00000-00003-A-01-1_001 SYSTEM "ICN-30-A-320000-0-00000-00003-A-01-1_001.cgm" NDATA cgm>
<!NOTATION jpg SYSTEM "jpg">
]>
<dmodule xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:noNamespaceSchemaLocation="http://www.s1000d.org/S1000D_2-0/xml_schema/dm/descriptSchema.xsd" xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:dc="http://www.purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">
<figure boardno="ICN-30-A-320000-0-00000-00001-A-01-1_001"/>
<figure boardno="ICN-30-A-320000-0-00000-00002-A-01-1_001"/>
<figure boardno="ICN-30-A-320000-0-00000-00003-A-01-1_001"/>
</dmodule>

При любом преобразовании DOCTYPE со всем содержимым исчезает!

Как оставить после преобразования Doctype неизменным?
Да ивообще оставить?

Перерыл все, знаю что можно добавить в output, но у меня же неизвестное количество и названия сущностей!

Ну к примеру:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<xsl:stylesheet version="1.0" xmlns:xsl="http://www.w3.org/1999/XSL/Transform" xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema" xmlns:fn="http://www.w3.org/2005/xpath-functions" xmlns:xdt="http://www.w3.org/2005/xpath-datatypes">
<xsl:output method="xml" version="1.0" encoding="UTF-8" indent="no"/>

<xsl:template match="@*|node()">
<xsl:copy>
<xsl:apply-templates select="@*|node()"/>
</xsl:copy>
</xsl:template>

</xsl:stylesheet>

На выходе:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<dmodule xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:noNamespaceSchemaLocation="http://www.s1000d.org/S1000D_2-0/xml_schema/dm/descriptSchema.xsd" xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:dc="http://www.purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink">
<figure boardno="ICN-30-A-320000-0-00000-00001-A-01-1_001"/>
<figure boardno="ICN-30-A-320000-0-00000-00002-A-01-1_001"/>
<figure boardno="ICN-30-A-320000-0-00000-00003-A-01-1_001"/>
</dmodule>

На выходе нет Doctype и всех Entity?
А мне их нужно оставить!!!

К сожаление они разные!
Могут быть какие угодно.

Я думаю может есть какие-то настройки парсеров, чтобы копировать DOCTYPE неизменным.
В msxml ничего не нашел.

Больше не знаю с какой стороны подойти.

Да я могу сгенерировать таким образом новый блок DOCTYPE c Entity, но неужели нет других вариантов для простого полного копирования Doctype.
Тем более, что я столкнулся с проблемой:
таким образом трансформация через DOMDocument не выполняется
ValidateonParse = false
Async= false
но на выходе если я генерю Doctype через XSLT, получаю пустой документ.

Я готов использовать и Saxon, только скажите, что он может просто копировать блок DOCTYPE (без участия генерации entity посредством XSLT)!

http://www.dpawson.co.uk/xsl/sect2/N2281.html#d4029e49