правильно что не сработало, тови теги Фамилия, Имя , Отчество находятся в теге ФИО, а цикл у тебя по какому тегу?
Вот такого достаточно:
<xsl:for-each select="Файл/ПачкаВходящихДокументов/ПОРУЧЕНИЕ/ФИО">
<xsl:value-of select="Фамилия"/>,
<xsl:value-of select="Имя"/>,
<xsl:value-of select="Отчество"/>,
</xsl:for-each>
Общий принцип:
Пиши выборку конкретного значения в отдельный шаблон, в пути укажи путь:
xml:
<Файл>
<ПачкаВходящихДокументов>
<ПОРУЧЕНИЕ>
<НомерВпачке>3</НомерВпачке>
<НомерВмассиве>00002</НомерВмассиве>
<ФИО>
<Фамилия>Иванов</Фамилия>
<Имя>Иван</Имя>
<Отчество>Иванович</Отчество>
</ФИО>
</ПОРУЧЕНИЕ>
<ПОРУЧЕНИЕ>
<ФИО>
<Фамилия>Петров</Фамилия>
<Имя>Петр</Имя>
<Отчество>Петрович</Отчество>
</ФИО>
</ПОРУЧЕНИЕ>
</ПачкаВходящихДокументов>
</Файл>

xsl:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<xsl:stylesheet xmlns:xsl="http://www.w3.org/1999/XSL/Transform" version="2.0"
xmlns:sch="http://www.ascc.net/xml/schematron">

<xsl:template match="/">
<xsl:for-each select="Файл/ПачкаВходящихДокументов/ПОРУЧЕНИЕ">
НомерВпачке = <xsl:value-of select="НомерВпачке"/>,
НомерВмассиве = <xsl:value-of select="НомерВмассиве"/>,
</xsl:for-each>
<xsl:apply-templates select="//ПОРУЧЕНИЕ/ФИО"/>

</xsl:template>
<xsl:template match="//ПОРУЧЕНИЕ/ФИО">
<xsl:value-of select="Фамилия"/>,
<xsl:value-of select="Имя"/>,
<xsl:value-of select="Отчество"/>,
</xsl:template>
</xsl:stylesheet>

SuSa
Общий принцип:
Пиши выборку конкретного значения в отдельный шаблон, в пути укажи путь:

Сори :) ляпнул некрасиво. В смысле в вызови шаблон по обработке конкретного узла, а в аттрибут match передай место где искать. Запись типа : "//ПОРУЧЕНИЕ/ФИО" - обозначает, что тег (нод) ФИО находится в теге ПОРУЧЕНИЕ, который в свою очередь лежит фиг знает еще в чем.