>но нужно реагировать не только переходом на другую страницу,
>но и показать какой нибудь всплывающее окно к примеру.

В html+JS ...onClick="console.log('показать окно 1')"...

В java android:




И на этом построен фреймворк PhoneGap

>а это webview.loadUrl("javascript:open(...)"); для чего?

Это просто пример возможности
вызова JavaScript в Html из Java в Android
В обычной Java такое невозможно.
Да в ней вообще JavaScript в Html не работает
и Html+CSS ограничены, а в Java в Android - Html 5.

> а подскажите пожалуйста как распространять прогу с raw ресурсами?

raw ресурсы входят в установочный файл apk, который является архивом zip
и похоже что другого способа переноса программы в android нет.


> их надо как то отдельно куда то засовывать при инсталяции?

инсталяцию выполняет android без участия программы и засовывает все очень далеко


>или если без raw делать то как лучше хранить html странички? в строковые ресурсы?

файлы html лучше в raw иначе возможна путаница с тегами и кавычками
и похоже что другого способа передать программе файлы при установке кроме ресурсов нет
Зато при запуске установленной программы она может писать все что угодно
Проще всего в /sdcard/имя программы/...
хотя где то читал что официально рекомендуют в /sdcard/android/data/имя пакета/...
можно попробовать в
getCacheDir().getAbsolutePath();
getFilesDir().getAbsolutePath();
getApplicationInfo().dataDir;
но они недоступны без root, пропадают при переустановке и
расходуют память для программ, которой часто не хватает