SP2013.
Написан простенький TimerJob, запуск стоит ежедневно в 6 утра. выполняется один раз и все. на след день не срабатывает.
В журнале заданий не появился, хотя в журнале запланированных заданий на завтра этот таймерджоб каждый день есть!

Решение найдено.
Открываем папочку "C:\ProgramData\Microsoft\SharePoint\Config\{ваш guid}"
Удаляем оттуда все XMl файлы конфигураций и чистим файлик "cache.ini", не удаляем его.
XML файлы потом сгенерируются сами, для надежности я еще перезапустил службу "Timer Service".