GustlyВозможное решение, на метод onlick чекбоксов вешать ajax методы для инсерты во временную таблицу, в которой будут содержаться выделенные строки, но с ajax слабо знаком. Есть еще идеи или как реализовать через ajax?

Пример, как сделать через AJAX: http://www.talkapex.com/2009/01/apex-report-with-checkboxes-advanced.html

Вместо хранения выбранных флажков в поле или переменной приложения, Вы можете использовать коллекции APEX.

Gustly,

столбец со скрытыми полями , в которых будет храниться seq_id, поможет.

GustlyЕсть 2-я проблема. У меня в шапке таблицы есть мастергалочка, которая ставит выделение на все галочки таблицы. В итоге будет повторный клик и в коллекцию попадут повторные записи. Не хотелось бы потом делать дистинкт. Можно ли как-нибудь этого избежать?

RTFM APEX_COLLECTION.MERGE_MEMBERS . В случае с Вашей собственной таблицей вместо коллекций APEX можете использовать просто MERGE.

GustlyИ все таки чем хуже обычная моя таблица по сравнению с апексовой коллекцией?

Ничем, если доступ к записям в ней Вы разделяете по пользователям/сессиям и не забываете чистить.
GustlyИ нарисовалась еще более сложная проблема. Необходимо, чтобы если в таблице везде стоят галочки, мастергалочка (галочка при нажатие на которую все чекбоксы таблицы чекаются) тоже ставилась. И чтобы когда шагаешь по страницам через pagination, эта мастергалочка обновлялась, если галочки таблицы выставлены все/не все.

Делайте через DA на After Refresh региона с отчётом.