демона подвесить - пусть проверяет каталог
и запускает программу

ну пишешь скрипт или прогу которая смотрит на каталог,
запоминает файлы и если не совпадает с предыдущем состоянием -решает добавился ли файл. Это просто. А что что ты не root- это фигово, но можно попробовать повесить ее как "nohup my_program &".
Только в этом случае она будет отрабатывать не "тотчас же", а в соответстви с периодом опроса. Если наде еще жестче - то есть и другая идея :))