// Класс подготовки sql выражения и параметров к запросу:
class Select {
    protected $parts = array( 'from'=>array(), 'select'=>array(), 'where'=>array() /*, и другие запчасти выражения...*/ );
    protected $bindData = array();

    public function From($table, $alias)
    {
        $this->parts['from'][$alias] = $table;
    }
    public function Where($col, $data)
    {
        $this->parts['where'][$col] = '?';
        $this->bindData[$col] = $data;
    }
    // ... и другие методы сброки запчастей запроса и параметров к нему... не суть важно как.

    public function toString()
    {
        // формирует из массива строку запроса, тоже не вопрос.
    }
}

// вот предмет вопроса:
// класс определяющий статический, наследуемый метод для подготовки выражения запроса
// и метод объекта, который отдает данные вызывая статикой подготовку запроса
class Base
{
    protected $db = null;

    // собственно заглушка. Наверное можно сделать даже abstract, не пробовал.
    static public function getSql( Select $sql, array $params ) { return false; }

    // конструктор объекта, формирует подключение объекта к БД... спосбо не важен.
    function __construct( ) {
        $this->db = // ... здесь генерируется соединения с базой тем или иным способом
    }

    // метод объекта, отдает данные из БД, похоже в нём и проблема:
    public function getData(array $params) {
        $className = get_class($this);

        // получаем строку запроса тем способом, который определен в дочернем классе, подсовывая ему новый объект выражения:
        $sql = call_user_func($className.'::getSql', new Select, $params);

        // отдаем данные через объект подключения к БД дочернего объекта:
        return $this->db->query( $sql->toString(), $sql->bindData );
    }
}

// дочерний класс А - реализует свой способ доступа к данным (часть запроса):
class A extends Base {
    static function getSql( Select $sql, array $params)
    {
        $sql->From('table1', 'a');
        if( isset($params['col1']) ) { $sql->Where('col1', $params['col1']); }
        return $sql->toString();
    }
}

// дочерний класс В -- имеет в подчинении объекты класса А и вызывает явно его статический метод для "досборки запроса"
class B extends Base {
    static function getSql( Select $sql, array $params)
    {
        $sql->From(A::getSql(new Select, $params['A']), 'b');
        $sql->Where('col2', $params['col2']);
        return $sql->toString();
    }
}

$object = new B;

$rows = $object->getData(array('A'=> array('col1'=>1), 'col2' => 'test'));

array(
    'regionTable'  => array('with' => array(id1, id2, id3), withOr=>true, 'withOut'=>array(id4))
    , 'cityTable'   => array('withOut'=>id5)
    , 'pricesTable' => array('with'=>array('goods_paramsTable'=>array('name'=>'длина', 'condition'=>'<4')))
    , 'rubricTable' => array('anyierarchyName'=>array('good'=>'доска'), 'withOut'=>id6)
    , 'mailTable'   => array('where'=>array('sended_at' => '<NOW() INTERVAL -1 HOUR'))
);

function getModeSelector(array $list = null, array $params = array(... набор условий по умолчанию...) )
{
    if( !isset($list)) ) {
        $modeModel = new Model();
        $params['modelTable'] = array('cols'=>array(), 'where'=>'..', ..);
        $list = $modeModel->getData($params);
    }
    $result = array();
    foreach( $list as $num => $item) {
         $result[] = .. преобразование по набору условий из второго параметра $params;
    }
    return $result;
}

function getModeSelector(array $list = null, array $params = array(... набор условий по умолчанию...) )
{
    if( !isset($list)) ) {
        $modeModel = new Model();
        $params['modelTable'] = array('cols'=>array(), 'where'=>'..', ..);
        $list = $modeModel->getData($params);
    }
    $result = array();
    foreach( $list as $num => $item) {
         $result[] = .. преобразование по набору условий из второго параметра $params;
    }
    return $result;
}

// Класс подготовки sql выражения и параметров к запросу -- исключительно для примеру.
// Показать что оно только оперирует со своей структурой объекта и больше ничего не делает:
class Select {
    protected $parts = array( 'from'=>array(), 'select'=>array(), 'where'=>array() /*, и другие запчасти выражения...*/ );
    protected $bindData = array();

    public function From($table, $alias)
    {
        $this->parts['from'][$alias] = $table;
    }
    public function Where($col, $data)
    {
        $this->parts['where'][$col] = '?';
        $this->bindData[$col] = $data;
    }
    // ... и другие методы сброки запчастей запроса и параметров к нему... не суть важно как.

    public function toString()
    {
        // формирует из массива строку запроса, тоже не вопрос.
    }
}

// вот предмет вопроса:
// класс определяющий статический, наследуемый метод для подготовки выражения запроса
// и метод объекта, который отдает данные вызывая статикой подготовку запроса
class Base
{
    protected $db = null;

    // собственно заглушка. Наверное можно сделать даже abstract, не пробовал.
    static public function getSql( Select $sql, array $params ) { return false; }

    // конструктор объекта, формирует подключение объекта к БД... способ не важен.
    function __construct( ) {
        $this->db = // ... здесь генерируется соединения с базой тем или иным способом
    }

    // метод объекта, отдает данные из БД, <<<<< похоже в нём и проблема: >>>>>
    public function getData(array $params)
    {
        $className = get_class($this);

        // получаем строку запроса тем способом, который определен в дочернем(!) классе, подсовывая ему новый объект выражения:
        // в PHP 5.3 можно вызывать напрямую через переменную - квалификатор класса. У меня 5.2.17 - приходится так:
        $funcName = $className . '::getSql';
        $sql = call_user_func($funcName, new Select, $params);

        // отдаем данные через объект подключения к БД дочернего объекта:
        return $this->db->query( $sql->toString(), $sql->bindData );
    }
}

// дочерний класс А - реализует свой способ доступа к данным (часть запроса):
// идея в том, что то что "умеет" делать объект этого класса - собрано тут
// , а не размазано по всему коду моделей прямыми или не очень запросами... см. далее "применение". 
class A extends Base {
    static function getSql( Select $sql, array $params) // return modified Select object!
    {
        $sql->From('table1', 'a');
        if( isset($params['col1']) ) { $sql->Where('col1', $params['col1']); }
        return $sql;
    }
}

// дочерний класс В -- имеет в подчинении объекты класса А и вызывает явно его статический метод для "досборки запроса"
// это и есть причина, почему метод сборки запроса - статический: он может вызываться напрямую у тех классов
// , которые "знают" что есть зависимые от них сущности... или от которых они зависят (reference map в ZF или где ещё)
// Поскольку не создается куча зависимых объектов "прочих классов", такой подход - значительно экононмнее и шустрее:
class B extends Base {
    static function getSql( Select $sql, array $params)
    {
        $subSelect = ( A::getSql(new Select, $params['A']) )->toString();
        $sql->From($subSelect, 'b');
        $sql->Where('col2', $params['B']['col2']);
        return $sql;
    }
}

// включил в общее описание примере и вызов КАк оно используется там, где валится:
class ModeModel {
    public static function getModeSelector(array $list = null, array $params = array(... набор условий по умолчанию...) )
    {
        if( !isset($list)) ) {
            $modeModel = new B();
            $params['B'] = array('col1'=>'this_const_string', 'limit'=>array('count'=>50, 'offset'=>0)); // $params['col2'] - как приходит, так и передается дальше.
            $list = $modeModel->getData($params);
        }
        $result = array();
        foreach( $list as $num => $item) {
             $result[] = .. преобразование по набору условий из второго параметра $params;
        }
        return $result;
    }
}

// Действие контроллера ZF, которое вызывает эту функцию
// (создается объект класса и вызывается его метод в диспетчере запросов ZF)
//, который сам вызывается из index.php, на который перенаправлены все урлы в .htaccess
//
class SomeController extends Zend_Controller_Action {

    // @params $_GET['id'], .. and other params from user request...
    public function someAction() {
       // ... валидация пришедших параметров урла запроса
       // ...
       $this->view->modeOptions = ModeModel::getModeSelector(
            array( 'A' => array(
                'col2' => (int)$_GET['id']
            ))
        );
    }
}